征服地區持續到現在的大清洗主要集中在兩個方面。
東歐劇變之後，巴爾幹半島的國家集體轉投了西方，許多原本親近蘇聯的政客也改變了立場。客觀來說在這件事上這些政客並不需要承擔主要責任，戈爾巴喬夫和葉利欽這類侵蝕內部蘇聯的蛀蟲、東歐革命不徹底導致資本主義既得利益者未能完全消失反而滲透進政黨、以及蘇聯國內越來越糟糕的經濟狀況等等繁多的原因才是問題的根源，想要弄清楚其中的所有緣由需要長時間細緻地調查與學習。
蘇聯解體之後東歐某些有些頗有手段的政客還讓國家經濟在短時間內飛速發展，其內政外交的能力不可謂不是出類拔萃。然而徹底倒向西方之後，歐美財閥藉由他們推行的自由貿易加入東歐市場，之前暢飲的毒酒解渴的代價很快就顯現了出來，原本被蘇聯扶持的工業強國徹底失去了自己先進的工業生產能力，只能依靠外部輸血，任由歐美財閥掠奪對內大肆掠奪。吸取了東歐劇變教訓的拉托維尼亞自然明白問題出在哪裡，要從哪些方面著手解決。
在著手發展重工業之前，拉托維尼亞情報部門發起的大清洗首先針對的就是行政體系。
尼克·弗瑞饒坐在機場候機座位上，饒有興致地翻看著這份清洗名錄，名單上的所有人無一例外全都是掌控重工業資源的企業擁有者，從鄉鎮企業到上市公司應有盡有。他並非完全加入不朽之城的情報序列，但不朽之城還是指名讓他參與一部分清洗工作，尼克·弗瑞也從另一個角度看待了如今拉托維尼亞的問題——和美國一樣，每一個鄉鎮裡都有一個掌控著當地企業與資源的精英家族，這樣的家族之間又形成了一個個小圈子，這些人就是資本主義的核心力量，也是導致東歐工業急速滑坡的原因之一。
這是東歐投靠社會主義之後未能解決的問題，如今為了徹底解決歷史遺留問題，解決城鎮工商業資本主義徹底掐死，將鋼鐵、煤炭、土地以及大量生產設施等資源用武力收歸國有，由斯蒂芬妮·馬利克挑選的會計人員成批地入駐那些由外國人開辦的企業，士兵們大肆抓捕所有境內的董事會成員。
只有完成了這部分清洗才能專心發展國有重工業，避免重蹈過去東歐工業的覆轍，而重工業將會是未來拉托維尼亞的生命線。維克多·馮·杜姆可不想和讓那些富人將手伸進行政體系，政商旋轉門這種事絕對不能發生在拉托維尼亞。從這些富人口中獲得的情報又幫助情報部門進一步鎖定了收受賄賂的政客，即便逃出境外也會被強行帶回來接受審判。尼克·弗瑞則要指揮禁衛軍麾下的特工與情報部門的維多利亞·漢德合作，抓捕那些外國政客親屬掛名的企業高層。
第一次清洗只是粗略地抓捕頭目，現在這一次清洗則是徹徹底底要將征服地區洗刷成君主心中的模樣。因此這場大清洗可以說是對整個巴爾幹半島的政治經濟體制的巨大轉變，但是得益於行政部門的高效工作，混亂並沒有蔓延太廣，針對行政體系的大清洗並未波及太多下層平民。現有透過民主投票選出的政客只要沒有觸犯原則性底線就大多得以儲存，畢竟這些政客的作用就是坐在那個位置上聽從拉托維尼亞的命令，為培養屬於拉托維尼亞的當地人高層官員爭取時間時間。有些工人驚訝地發現自己工作的公司在停業幾天、換上了新的名字之後就重新開工，公司從上層到中層的所有管理人員全都換了個遍，所有工人過去的合同全都作廢，一份更加有保障的合同被髮到了他們的手裡，也有許多原本因為擔心自己失業的工人也在看到企業重新開業之後放棄了反抗，選擇重新開始生產工作。
大清洗的第二目標就是軍隊。
巴爾幹半島這些國家的軍隊的戰鬥力非常糟糕，不僅缺乏訓練，而且缺乏對先進武器裝置的操作經驗。北約的軍事教官教授的戰術條例依照的全都是美軍在中東和阿富汗打治安戰總結出來的經驗與戰術，在不擁有美軍的絕對制空權的情況下，這種治安戰戰術並不適用現在的情況。但這並不是大問題，拉托維尼亞的戰術操典能夠很好的解決問題，真正的問題是常年來巴爾幹半島的軍隊十分依賴北約的軍事援助，在於歐美軍隊常年接觸中導致軍隊貪汙腐敗極度嚴重，軍紀極度渙散，部分高層軍官更是成為了拿著好幾份津貼、依靠販賣情報賺錢的間諜。
由於軍隊內部的事務不會影響到平民，因此當拉托維尼亞接手軍隊之後第一時間就開啟了極為嚴厲的清洗。幾乎所有高層軍官都遭受堪比中情局手段的極端審問，大量中下層軍官被新成立的軍事法庭審判然後送進監獄，只有少部分被證明獨善其身的好人才能夠倖免於難並且被提拔，就連許多低階士兵都在經歷問詢之後被責令接受懲罰。身穿黑色大衣、頭戴鑲嵌著黃銅鷹徽的大簷帽的政委在宣讀了軍事法庭的審判結果之後，就在親衛隊的幫助下親手處決了被判處死刑的軍官。對軍隊清洗的第一天就有接近兩百人被處決，而觀看行刑計程車兵中有不少人都認得被處決的軍官。
幾乎所有被派去接受軍隊的政委都有過這樣的工作經歷，這些就軍紀官的工作不僅僅是在軍隊內推行《統一真理》，更是要負責整頓軍隊的腐敗問題、整肅軍紀、監督訓練、打造一支有信念的軍隊。這是一項非常非常困難的工作，因此所有政委都能獲得來自姐妹會和基因改造戰士的幫助，軍紀部門的索菲亞政委全權負責這一工作，她的手下是來自雪國失落之城的族人（現在的拉托維尼亞正是他們的血脈起源之地）。只有得到軍紀部門的同意，那些軍隊才有資格換裝新裝備，否則就將成為某種意義上的懲戒營，他們最後的價值只會剩下用生命為統一事業做出奉獻，又或者因為兵變被基因改造戰士和姐妹會用絕對的暴力消滅。
除此之外還有派遣暗殺者對國際貨幣基金組織決策者的暗殺威脅、冒名頂替，對主流媒體及其幕後投資者的徹底替換等等清洗在進行，但在前兩項清洗完成以前，剛剛統合半個巴爾幹半島的拉托維尼亞仍舊依靠著君主的個人戰鬥能力、斬首打擊、太空軍事力量強撐。雖然僅僅是君主一個人就能讓對拉托維尼亞虎視眈眈的西方國家望而卻步，但維克多·馮·杜姆卻沒有忘記拉托維尼亞建立的初衷，振興工業化的腳步刻不容緩，並且不能遭遇到任何阻礙，因此他打算在完成改革之前多讓自己的上司露面，提高威懾能力，為拉托維尼亞爭取時間。
“反正你的動力裝甲足夠耀眼。”維克多·馮·杜姆用毫無幽默感的聲音乾巴巴地說道，“我需要你去讓其他國家畏懼，就像你之前做的那樣。”
面對這樣的答案，薩洛蒙聳了聳肩，這對一個穿著動力裝甲的人來說可不容易。“面對一個身高三米的巨人難道不應該產生恐懼嗎？”他問，“我可不覺得我的身高比你的鐵面具更加適合國事訪問這項工作，如果可以的話，我還儘量避免在平民前露面避免嚇到他們。”
“平民百姓其實沒有那麼多意見，喊得最大聲的是政客、學生以及中產階級。不過那不是問題，基因改造戰士和姐妹會的鎮壓行動完全可以應付，等到我們組建由當地人組成的仲裁法庭，這些問題很快就會消失。人類崇拜強者，正因如此人類才會需要英雄。對於普通人來說，只要能夠吃飽穿暖就夠了，對於這些國家的平民來說，一個能夠保護他們生活的人就是英雄。”維克多·馮·杜姆說道。
薩洛蒙站在辦公桌前，等著他繼續往下說。
“你終結了駐外美軍的暴行，你頒佈法律清剿黑幫維護公正，你逮捕並清洗腐敗官員，你發展製造業挽救就業率，你重視農業保護所有人不受困與貧窮。所有的一切都能讓承受你恩惠的人將你看做英雄，通訊監控中心給出的資料表明，只要你曾經出現過的城市，其居民的反抗意志都會降到最低。所以有點成為英雄的自覺，你可不僅僅是一個王者，你對那些平民來說代表了希望，秩序與新時代。”